Môžeme ich rozdeliť na dve podskupiny:

• Otravy vzniknuté po požití potravy napadnutej baktériami, ktoré vo svojom tele vytvoria toxické látky (tzv. toxoinfekcie).
• Otravy vzniknuté po požití stravy už obsahujúcej bakteriálne alebo plesňové jedy čiže toxíny (tzv. toxikózy).

Na vznik toxoinfekcií i toxikóz je nutné, aby bola požívatina mikroorganizmami masívne infikovaná, aby sa tieto zárodky v potravinovej surovine, polotovare alebo v hotovom pokrme výdatne rozmnožili alebo mikroskopické huby vytvorili dostatok mycélií. K tomu prispeje rozomletie požívatiny či jej ponechanie v teplom a vlhkom prostredí.